More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  96.51 
 
 		 99 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  64 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.3 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  59.46 
 
 		 75 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  59.46 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  59.46 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  59.46 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  59.46 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  65.22 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  63.89 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  65 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  56.76 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  60.81 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  55.7 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  62.32 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55.7 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  63.38 
 
 		 75 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  51.76 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  61.97 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  65.22 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  55.7 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  66.18 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  61.33 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  61.43 
 
 		 214 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  61.97 
 
 		 206 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  47.67 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  65.22 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  58.9 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  54.05 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  66.67 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  66.67 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  68.12 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  65.22 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  51.81 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  62.12 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  57.35 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  62.32 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  60.76 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  56.76 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  62.32 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  62.32 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  60.87 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  62.32 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  62.32 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  64.29 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  63.24 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  57.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  61.43 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  62.32 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  54.43 
 
 		 81 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  63.64 
 
 		 84 aa  93.6  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  55.07 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  60.87 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  60.87 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  60.87 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  62.32 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  60.87 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 		 79 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  62.86 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  63.64 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  54.93 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  62.86 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  56.34 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  62.32 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>