More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3610 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  69.57 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  69.57 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  69.57 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  69.57 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  69.57 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  64.29 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  68.12 
 
 
84 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  68.12 
 
 
84 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  63.77 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  65.22 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  67.14 
 
 
85 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  62.32 
 
 
85 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  63.77 
 
 
84 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
136 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  65.71 
 
 
85 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  61.84 
 
 
86 aa  99.4  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  59.46 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  54.55 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  60.87 
 
 
105 aa  95.9  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  61.76 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.58 
 
 
84 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  53.95 
 
 
80 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
69 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.07 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  93.2  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  48.68 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  54.67 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
132 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.62 
 
 
99 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  56.76 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.65 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.65 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  61.29 
 
 
64 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  62.3 
 
 
75 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  53.62 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  53.95 
 
 
76 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  53.95 
 
 
76 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  42.11 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  60.66 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  48.65 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  48.1 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  48.75 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  59.46 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.17 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  45.21 
 
 
115 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  53.62 
 
 
97 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  47.95 
 
 
206 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  56.41 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  53.62 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  54.41 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>