More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2535 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.71 
 
 		 74 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 70 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  56.58 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  52 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  54.93 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  54.41 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  49.32 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  55.26 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  55.26 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  53.62 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  52.11 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  50.67 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  58.46 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  48.68 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  49.35 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.52 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  51.43 
 
 		 84 aa  84.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  58.11 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  52.17 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  57.58 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  52.78 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  52.17 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  48.65 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  49.33 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.93 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  49.33 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  56.92 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.86 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  54.29 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  50.72 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  52.86 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  53.52 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  50.68 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  50.72 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  62.3 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  57.38 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  51.39 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  49.33 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  54.69 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.72 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  59.68 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  52.94 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  52.94 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  52.94 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  52.94 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  52.17 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  48.57 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  54.93 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  51.95 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  49.3 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  47.89 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.94 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  51.47 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  57.58 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>