More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4170 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  80 
 
 
130 aa  207  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  70 
 
 
122 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  72.06 
 
 
92 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
132 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  64.62 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  61.76 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  58.9 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  60.29 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  62.69 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  52.33 
 
 
110 aa  90.9  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  60.29 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  56.16 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  55.26 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.12 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  57.35 
 
 
88 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  57.14 
 
 
73 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  58.82 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  57.35 
 
 
88 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  62.12 
 
 
86 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  57.35 
 
 
88 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  58.46 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  58.46 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  58.46 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  55.88 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  58.21 
 
 
70 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  51.19 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  52.44 
 
 
81 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  52.44 
 
 
81 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
69 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.52 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  58.46 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  58.11 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  56.06 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  48.61 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  58.82 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.22 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  48 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  52.11 
 
 
96 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  55.22 
 
 
123 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.94 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.94 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  61.54 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.43 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  52.17 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  44.94 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  53.42 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  52.7 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  43.59 
 
 
79 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  51.47 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  59.02 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  60.61 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  46.59 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  52.17 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  45.83 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  47.95 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
73 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  55 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  54.84 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.72 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  54.93 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>