More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3004 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  69.49 
 
 
71 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  69.49 
 
 
71 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.85 
 
 
99 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  53.62 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
69 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  95.9  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  53.85 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  51.28 
 
 
95 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.11 
 
 
82 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
70 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  52.17 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.43 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.85 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  47.5 
 
 
107 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  57.35 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.07 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  53.52 
 
 
74 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.81 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  46.59 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  47.89 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  47.89 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  48.61 
 
 
91 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  47.89 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  49.28 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.43 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  52.56 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  52.56 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  51.47 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  52.56 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  52.56 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55.88 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  49.28 
 
 
98 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  51.43 
 
 
94 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55.88 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  55.07 
 
 
79 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  40.22 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  53.62 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
75 aa  88.6  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55.88 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55.88 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  54.41 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  58.46 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  48.1 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.88 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
70 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  50.72 
 
 
105 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
69 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
76 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  47.14 
 
 
81 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.25 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  42.22 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4540  hypothetical protein  54.88 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50.7 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  49.3 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  49.28 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  53.16 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.71 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  41.11 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  56.92 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  46.48 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  43.37 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
71 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.25 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  41.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  43.37 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 
80 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  54.29 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  49.28 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>