More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2140 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  175  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  70 
 
 
91 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  63.64 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  61.97 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.12 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.42 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  59.42 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  67.74 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50.6 
 
 
92 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  55.41 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  46.75 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  61.76 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  58.57 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  55.56 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  56.76 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  58.11 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  53.42 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  60.32 
 
 
81 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  52.56 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  58.9 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  61.76 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  58.21 
 
 
95 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  55.22 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50.62 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  63.49 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.44 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  56.94 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.82 
 
 
84 aa  84.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  56.34 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  58.11 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  51.19 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  61.29 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  65.57 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52 
 
 
85 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
85 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  47.44 
 
 
85 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  61.19 
 
 
69 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  61.29 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  59.68 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  59.68 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  59.68 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  56.25 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  49.32 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  51.39 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  54.17 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  57.58 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  60.66 
 
 
64 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  58.06 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  59.7 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  58.06 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  52.24 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  58.06 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  58.06 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  45.57 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  56.45 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  46.75 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.45 
 
 
70 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  56.45 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  56.45 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  47.3 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  53.73 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  51.9 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  45.12 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.75 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  53.73 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.13 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.73 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>