More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4862 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  71.62 
 
 		 74 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  66.18 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  52.27 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  52.27 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  58.67 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  52.27 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  50.54 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 		 72 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  60.87 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  54.43 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.86 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  55.38 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  56.25 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  53.62 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  59.7 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  50.75 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  50.65 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.17 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  52.94 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  51.43 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.26 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.72 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.62 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.92 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  51.43 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.89 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.94 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  52.86 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  52.31 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  47.76 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  51.47 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  54.29 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  43.42 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  60.94 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.47 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  60.34 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  55.22 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  56.72 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50.75 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  48.72 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  76.6  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  52.7 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  51.47 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  53.03 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  54.79 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50.72 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  50.65 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  48.53 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.17 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  44.3 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  48.53 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  51.47 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>