More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3826 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  61.8 
 
 
96 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  57.14 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  73.53 
 
 
95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  69.86 
 
 
105 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  58.89 
 
 
98 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  65.71 
 
 
105 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  65.28 
 
 
100 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  64.29 
 
 
94 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  65.22 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  65.15 
 
 
82 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.29 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.16 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  56.92 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  56.92 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
85 aa  84.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  46.32 
 
 
110 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  53.52 
 
 
86 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  42.71 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  57.35 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  55.41 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  47.83 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  54.29 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.71 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.75 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.35 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  53.62 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.14 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.14 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.14 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.14 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  45.36 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  48.53 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  56.72 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  52.63 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  46 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.14 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  59.7 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  48.48 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  54.32 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  47.14 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.17 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  52.05 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  52.17 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  44.29 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  54.69 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50.75 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  44.71 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  54.79 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.52 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  47.14 
 
 
84 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  45.57 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  54.79 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.81 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  42.27 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.71 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  48.65 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>