More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3338 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  55.7 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  56.58 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  64.18 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  59.74 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  57.95 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  49.4 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  44.23 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  59.68 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  48.75 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  57.89 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  55.26 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.85 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  55.71 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.52 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  55.26 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  54.93 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  55.26 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  61.9 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  60.66 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  49.33 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  54.22 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  51.25 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  52.63 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.7 
 
 		 214 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  50.67 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  43.96 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  62.71 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.41 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  60.61 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  58.06 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  51.32 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  61.29 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  57.58 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  60.94 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  49.3 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  48.68 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  52.94 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  61.29 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.02 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  54.32 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  52.7 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  48.24 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  49.35 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.81 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  53.52 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  59.38 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  48.68 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  60.66 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.81 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  56.06 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  52.86 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  56.52 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  49.32 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  53.62 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  53.62 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.25 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  63.79 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  56.45 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  56.72 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  57.58 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  47.06 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50.67 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  51.85 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  45.88 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>