More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0355 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.7 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.7 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  64.18 
 
 
71 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  59.46 
 
 
124 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.72 
 
 
86 aa  93.2  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  52.24 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.94 
 
 
97 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.15 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  55.13 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  59.7 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  57.35 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1541  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  63.49 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  53.73 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  57.14 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  58.46 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  50 
 
 
85 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.07 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  55.22 
 
 
75 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  56.72 
 
 
94 aa  84.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.92 
 
 
70 aa  84.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  57.81 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  83.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
102 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  47.89 
 
 
78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  61.54 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.05 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.32 
 
 
92 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.38 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  60.94 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  53.52 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  52.86 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  60.32 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  53.03 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  53.03 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.94 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.48 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50.7 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  63.93 
 
 
64 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.69 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  46.58 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  46.48 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9606  predicted protein  55.56 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  52.31 
 
 
73 aa  80.5  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  53.03 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  53.03 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  46.58 
 
 
77 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  49.25 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  56.06 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  52.24 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  52.31 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  56.45 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  51.56 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
71 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  48.57 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  54.69 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  51.52 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.52 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  56.92 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>