More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1545 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
76 aa  155  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  64.94 
 
 
76 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
69 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  53.95 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
70 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  57.53 
 
 
79 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  57.33 
 
 
92 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  56.58 
 
 
115 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  57.53 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  56.16 
 
 
104 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  51.39 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  55.26 
 
 
88 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  90.5  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.71 
 
 
70 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  59.68 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  58.57 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  58.46 
 
 
82 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  56.92 
 
 
79 aa  87  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  52.46 
 
 
73 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  58.46 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
73 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  53.62 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  55.38 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  51.35 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  56.25 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  52.78 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.25 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  48.57 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  57.81 
 
 
81 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  59.09 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  53.62 
 
 
84 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
70 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  50.7 
 
 
86 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
87 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  64.52 
 
 
63 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.68 
 
 
97 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  54.69 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  55.74 
 
 
80 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  58.46 
 
 
78 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.52 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  56.06 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.69 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  62.9 
 
 
63 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.81 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  54.69 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1541  protein of unknown function DUF37  52.7 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  43.42 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  60.61 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  49.28 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.32 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  56.16 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  54.69 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  57.97 
 
 
68 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  55.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  51.32 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.17 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  59.68 
 
 
63 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  52.31 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  49.23 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>