More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0331 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  67.12 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  72.22 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  70.83 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  70.83 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  70.83 
 
 		 80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  69.44 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  50.63 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  61.97 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  54.29 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  58.21 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  54.79 
 
 		 85 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  54.84 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  54.84 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  53.42 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  53.42 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  56.34 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.84 
 
 		 84 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.03 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  51.39 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  53.23 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50.68 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  62.71 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  56.92 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  54.29 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  49.25 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  55.74 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  54.55 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  51.39 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.72 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  55.74 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  55.07 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  54.84 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  53.73 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  52.46 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  48.57 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  48.61 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  48.61 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  52.24 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  62.07 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  51.52 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  47.14 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  53.23 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  51.39 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  52.46 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  55.17 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  55.07 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  51.43 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7339  hypothetical protein  52.05 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  59.32 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  58.62 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  51.56 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  48.48 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>