More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6057 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  69.7 
 
 		 98 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  70.48 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  68.69 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  65.62 
 
 		 94 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  76.81 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  67.42 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  65.43 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  60.23 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  58.57 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.21 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  61.97 
 
 		 75 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  56 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.56 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  57.14 
 
 		 70 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  61.54 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  42.53 
 
 		 206 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  60.87 
 
 		 98 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.07 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  57.97 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  52.7 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.33 
 
 		 76 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  45.16 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  53.42 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.56 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  53.42 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  52.7 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  49.28 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  52 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50.63 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  59.42 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  56.94 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  45.56 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  45.56 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  59.42 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  44.21 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  57.97 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.35 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  43.37 
 
 		 214 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  54.05 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 98 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  51.95 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50.7 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  51.95 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  51.95 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.09 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  53.62 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  57.53 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  49.25 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  45.83 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50.72 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  46.59 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  53.62 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  48.65 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  51.39 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  50.72 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  48.65 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 70 aa  83.6  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  47.22 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  53.62 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  47.22 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  48.65 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>