More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_4015 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  190  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  57.33 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  59.7 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  60.87 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  54.93 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  48.72 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  59.09 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 79 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.94 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.72 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.73 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  58.46 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.92 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  58.46 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  61.54 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  60.94 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  59.38 
 
 		 81 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  56.72 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  53.52 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  58.21 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  56.92 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  48 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  54.93 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  56.72 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.73 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  56.92 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  59.38 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  58.46 
 
 		 97 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  51.28 
 
 		 101 aa  84.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  55.56 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  60.94 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  56.06 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  55.38 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1541  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  53.73 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  53.73 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  53.73 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  55.38 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.81 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  53.73 
 
 		 206 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  54.41 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  53.73 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.25 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.73 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  56.25 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50.75 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  58.46 
 
 		 84 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  53.73 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  59.09 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  55.38 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  52.24 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.06 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  56.67 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  55.38 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  53.03 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.05 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  58.21 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  52.24 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>