More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1541 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1541  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 117 aa  243  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  52.24 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  50.75 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.73 
 
 		 91 aa  84.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  84.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  48.65 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  54.41 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.7 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  52.24 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  47.3 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.25 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.03 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  51.56 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  56.25 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  57.63 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  51.56 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  44.59 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  49.25 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  53.97 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  47.06 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  44.12 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  47.76 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  47.76 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  53.03 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  49.25 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  44.93 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  46.27 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  47.76 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  44.12 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  48.44 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4540  hypothetical protein  56.72 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  45.59 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  53.12 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  51.56 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  42.67 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  45.59 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  51.56 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  46.88 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  45.33 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  49.25 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  47.76 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  48.44 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  49.21 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  43.08 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  43.28 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  48.53 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.36 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  41.89 
 
 		 88 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  45.45 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  49.25 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  55.36 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  44.78 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  42.65 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  48.44 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  48.44 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  47.76 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  49.25 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.52 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  45.59 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  43.28 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  56.25 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.88 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>