More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0034 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  100 
 
 
71 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
71 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  62.32 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  57.97 
 
 
75 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  62.5 
 
 
69 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56.52 
 
 
76 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  63.08 
 
 
84 aa  93.6  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.38 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.52 
 
 
74 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  61.54 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  54.41 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  50.7 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.72 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  53.62 
 
 
84 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  55.07 
 
 
107 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  59.38 
 
 
72 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  55.22 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  60 
 
 
77 aa  87.8  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
79 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
79 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
70 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.29 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
85 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  56.25 
 
 
86 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.17 
 
 
77 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  59.38 
 
 
91 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  59.38 
 
 
105 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  58.46 
 
 
84 aa  87  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  59.68 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  59.68 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  55.71 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  59.09 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  52.17 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  52.17 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  52.17 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  53.62 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  52.94 
 
 
105 aa  84.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.07 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.73 
 
 
74 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  49.28 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  55.07 
 
 
86 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
107 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.72 
 
 
75 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  55.71 
 
 
79 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  52.17 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  54.84 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.61 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  46.38 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  54.84 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  51.56 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>