More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3377 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
124 aa  249  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  60.53 
 
 
115 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  63.24 
 
 
100 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  52.87 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  55.7 
 
 
98 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 
91 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  59.46 
 
 
79 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.12 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 
144 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.62 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  55.42 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  55.42 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  55.42 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  54.22 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  54.22 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  54.22 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  56.06 
 
 
71 aa  90.5  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  51.25 
 
 
86 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  53.01 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.05 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  53.33 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  85.9  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  53.42 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  55.88 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  50.77 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  58.82 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  47.62 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  58.82 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  43.68 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  46.73 
 
 
206 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  48.89 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  48.72 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  54.41 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  49.25 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  47.62 
 
 
68 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  41.67 
 
 
97 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.92 
 
 
105 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  46.15 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.38 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  41.11 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  45.21 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  47.83 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  45.21 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  57.53 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  49.25 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  47.95 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  44 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  46.97 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.86 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  49.21 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  47.22 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  49.38 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.03 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  46.91 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  44.59 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  45.45 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  47.14 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>