More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_27020 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  69.01 
 
 
100 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  66.67 
 
 
76 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  66.67 
 
 
76 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  65.71 
 
 
76 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  58.54 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  67.69 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  44.44 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  59.72 
 
 
91 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  56.52 
 
 
82 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  53.73 
 
 
86 aa  90.5  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  57.89 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  55.71 
 
 
206 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  55.71 
 
 
214 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  61.54 
 
 
69 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  61.54 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 
87 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  59.09 
 
 
71 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  43.01 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  38.54 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  53.85 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  51.39 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  47.37 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  47.56 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.97 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  47.44 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  49.41 
 
 
87 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  56.52 
 
 
91 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.41 
 
 
97 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  53.03 
 
 
131 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.38 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  55.07 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  46.67 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  48.19 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  42.71 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  53.97 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  52.17 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.69 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  46.75 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  55.38 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.57 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  44.93 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  44.62 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.25 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  53.62 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  51.85 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  56.34 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.07 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  45.59 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  45.68 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  45.74 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.07 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  52.24 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  40 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  46.88 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  46.88 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  47.22 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>