More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  100 
 
 		 100 aa  203  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  58 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  61.33 
 
 		 105 aa  94  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  63.01 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  54.22 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  55.71 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.81 
 
 		 206 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  65.15 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  66.67 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  59.15 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  51.81 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  54.05 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  47.56 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.72 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  51.95 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  63.64 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  63.64 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  60.61 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  57.69 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  51.39 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  51.39 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  60.26 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  54.79 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  63.64 
 
 		 98 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  60.94 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  48.61 
 
 		 91 aa  84.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  58.21 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  56.06 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  60.94 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  47.78 
 
 		 107 aa  83.6  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  60.61 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  51.47 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  56.34 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  54.93 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  51.16 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  55.26 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  51.39 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  61.29 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  59.09 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  59.09 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  58.21 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  56.34 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  54.41 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.31 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  54.93 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.11 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  52.78 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  55.71 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  62.69 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.94 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  47.19 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.11 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  52.11 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.11 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  51.47 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.11 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.11 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  54.93 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  53.62 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  59.09 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  52.11 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  59.09 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  54.55 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  59.09 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>