More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2437 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  60.26 
 
 
81 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.69 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.69 
 
 
81 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.41 
 
 
81 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.86 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  64.29 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  55.13 
 
 
81 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  55.13 
 
 
81 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  62.86 
 
 
88 aa  93.2  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  57.97 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  55.71 
 
 
75 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  56.52 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  56.52 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  55.07 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  57.97 
 
 
76 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.85 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.86 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  49.33 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  54.29 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.47 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  46.15 
 
 
98 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.79 
 
 
82 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
69 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
136 aa  84  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  52.86 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  52.86 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  48 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  48 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  55.71 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  53.73 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  51.43 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.86 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  53.73 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  55.88 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  53.52 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  45.95 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  52.24 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  58.62 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  48.68 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  47.14 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.73 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  50.68 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.78 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  48.57 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  48.57 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  48.57 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.53 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  49.23 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.17 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>