More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5094 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
93 aa  182  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  70.15 
 
 
89 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  68.66 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  52.11 
 
 
75 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  64.06 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  63.08 
 
 
69 aa  87  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  57.58 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.7 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  64.62 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.3 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  61.54 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  58.21 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
98 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  52.05 
 
 
81 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  56.92 
 
 
85 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  51.85 
 
 
86 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  56.92 
 
 
85 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  59.09 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  57.58 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.58 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  60 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.38 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.21 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  52 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  60.94 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  61.54 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.19 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  54.55 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
75 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.22 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  51.47 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  53.85 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  60 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  53.62 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  60.94 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  54.17 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  53.03 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  53.85 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  53.03 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  54.55 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.92 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  53.03 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  51.32 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  58.46 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  56.92 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  59.68 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  48 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.63 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  46.48 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  59.38 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>