More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2556 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.81 
 
 		 100 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  60.32 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  46.81 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  55.56 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  48.44 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  52.17 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  49.38 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  57.81 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.81 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  56.25 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  56.25 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  49.38 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  51.22 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  55.22 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  53.12 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.12 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.56 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  55.74 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  46.91 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  47.06 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.56 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  46.25 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  50.75 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  50 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  49.23 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  53.85 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  52.46 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  52.31 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  52.05 
 
 		 80 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.68 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  59.02 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  45.12 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.62 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  46.88 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  46.75 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  48.44 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  49.18 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  53.52 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  46.38 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  57.14 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  55.74 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  52.31 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  51.67 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>