More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3467 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3562  hypothetical protein  77.59 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  64.29 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 		 80 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  66.2 
 
 		 71 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  61.76 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  60.29 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  65.57 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  62.12 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  57.35 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.58 
 
 		 76 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  57.35 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  59.38 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  59.38 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  59.38 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  59.38 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  59.38 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  61.9 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.81 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  58.46 
 
 		 82 aa  84.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  55.88 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  57.35 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  57.35 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  51.52 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  65.62 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  51.52 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  51.52 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  51.52 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  53.12 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  48.53 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  53.12 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  57.97 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  49.25 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  56.92 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  59.65 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  62.07 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  61.4 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  52.24 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  54.69 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  52.31 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.61 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  54.69 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.12 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  55.74 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  57.89 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.25 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  55.74 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  57.38 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  53.12 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  59.65 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.06 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  59.02 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  59.65 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  59.65 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  59.65 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  47.06 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  53.12 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  59.65 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  53.12 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  57.89 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  55.74 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  55.74 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>