More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2596 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
70 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  57.97 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.32 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  53.95 
 
 
79 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  61.43 
 
 
86 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  56.96 
 
 
84 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  54.79 
 
 
86 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  61.97 
 
 
110 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  54.67 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  69.35 
 
 
64 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  59.15 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  54.05 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  60.87 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.67 
 
 
75 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  58.33 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  51.35 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
71 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  55.07 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  56 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52.44 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  56.94 
 
 
85 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  55.41 
 
 
206 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  51.35 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  67.21 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  55.71 
 
 
214 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
78 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50.63 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  48 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  48 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  49.33 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  59.42 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  61.43 
 
 
70 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  64.06 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  87  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.63 
 
 
79 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.63 
 
 
79 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.17 
 
 
85 aa  86.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.97 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  65.08 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  57.14 
 
 
74 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  57.58 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  59.09 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  65.08 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  55.71 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  59.68 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  51.95 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  56.52 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.67 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  56.52 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  56.94 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>