More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4430 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  67.14 
 
 
70 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3562  hypothetical protein  70.69 
 
 
69 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  61.67 
 
 
68 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  63.93 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  65.57 
 
 
69 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
71 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  65.57 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  53.62 
 
 
70 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  58.33 
 
 
77 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  56.67 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
70 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  66.13 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  85.5  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  59.68 
 
 
71 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  58.33 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  55 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  50.77 
 
 
95 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  55 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  55.38 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  60 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  48.53 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  60 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50.77 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  56.67 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  51.67 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  58.33 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  48.53 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  52.17 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  56.67 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  57.89 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  53.33 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  57.38 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  57.38 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.82 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  58.62 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  46.38 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  58.33 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  51.67 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  48.53 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  48.53 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  49.28 
 
 
80 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  54.1 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  56.67 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.67 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  50.72 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  52.31 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.39 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.39 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  51.67 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  51.67 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  46.58 
 
 
91 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  62 
 
 
68 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  47.06 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  49.23 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.39 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  51.67 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>