More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1566 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  62.32 
 
 
81 aa  97.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  62.32 
 
 
81 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  60.98 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  67.74 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  91.3  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  55.88 
 
 
70 aa  90.9  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  47.44 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  62.69 
 
 
136 aa  90.1  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  58.46 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  62.69 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  60.87 
 
 
70 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  63.77 
 
 
69 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  65.22 
 
 
74 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
71 aa  87.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  56.72 
 
 
77 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  53.73 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  53.73 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  53.73 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  59.72 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  53.73 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  63.64 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.97 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  60.61 
 
 
72 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.73 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  61.9 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  53.42 
 
 
88 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  56.72 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  52.7 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  52.94 
 
 
70 aa  83.6  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
68 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0472  hypothetical protein  52.05 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000619487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  48.65 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  60.32 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  57.58 
 
 
81 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  50.75 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  52.31 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  52.31 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  56.92 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  59.09 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  60.32 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  48.72 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  56.06 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  58.21 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3060  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  50.63 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  54.55 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  55.22 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.85 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  47.5 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  56.25 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  50.68 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  56.06 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  53.73 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  56.92 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  50.68 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.72 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  52 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  56.16 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  50.77 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  49.23 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>