More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3060 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3060  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
165 aa  323  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  68.12 
 
 
76 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  68.12 
 
 
76 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  66.67 
 
 
76 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  52.11 
 
 
81 aa  87.4  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  52.11 
 
 
81 aa  87.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  61.97 
 
 
74 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  56.58 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  62.5 
 
 
105 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  43.59 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  64.62 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  57.14 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  47.14 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.92 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  52.05 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  60.61 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  47.89 
 
 
85 aa  79  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50.77 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  46.38 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  46.38 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  56.72 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.95 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  53.03 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  49.33 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.78 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  49.28 
 
 
82 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.28 
 
 
100 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  59.7 
 
 
93 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  51.39 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50.72 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7339  hypothetical protein  47.92 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.02 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  48.61 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  55.07 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  52.31 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  47.69 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  42.03 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  61.54 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  58.46 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  50.72 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.39 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  53.03 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  48.61 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  52.31 
 
 
87 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  47.69 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  52.31 
 
 
87 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  46.15 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.76 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  52.31 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  56.92 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  42.03 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  39.71 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  39.71 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  48.1 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>