More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4241 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
74 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  71.62 
 
 
115 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  63.24 
 
 
115 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  63.24 
 
 
120 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  65.22 
 
 
70 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  60.29 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  60.29 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  60.29 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  61.76 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  55.07 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  55.07 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  55.07 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  55.07 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  57.35 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  55.07 
 
 
75 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
75 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.17 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  62.69 
 
 
89 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.35 
 
 
84 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.52 
 
 
74 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  52.31 
 
 
72 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  59.09 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
72 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  59.09 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  63.08 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  55.38 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  49.28 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  57.35 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  46.27 
 
 
69 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  46.27 
 
 
69 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  50.72 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  55.38 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  54.79 
 
 
105 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  43.48 
 
 
81 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  58.06 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.22 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.21 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.22 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  59.72 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  59.7 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  53.85 
 
 
71 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  57.75 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.79 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  48.48 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1473  hypothetical protein  53.85 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  47.76 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.06 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  48.53 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  54.55 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  53.42 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  52.05 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.17 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  52.17 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  60.94 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  47.06 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  48.53 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  42.03 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.22 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.48 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>