More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4247 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  82.35 
 
 		 85 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  81.18 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  80 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  80 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  90.59 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  80 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  80 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  80 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  63.53 
 
 		 86 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  60 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  62.65 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  60.53 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  60.26 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  70.15 
 
 		 75 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  62.16 
 
 		 75 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  59.74 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  60.81 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  56.76 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  62.03 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  60.76 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  57.33 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  62.12 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  67.16 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.94 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  51.85 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  58.33 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  57.75 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  63.64 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  62.12 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  55.88 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  56.34 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  52.7 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  58.21 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  55.26 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  56.94 
 
 		 80 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  88.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  62.9 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  61.76 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  61.19 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  47.44 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  56.34 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  61.19 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  55.41 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  54.41 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.14 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4540  hypothetical protein  61.04 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.52 
 
 		 122 aa  87.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  59.09 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  55.22 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  53.25 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  53.73 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  55.07 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.73 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.63 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  48.65 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  48.65 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  51.47 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  48.65 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  48.65 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>