More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2522 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 94 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  69.57 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  65.98 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  63.83 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  63.83 
 
 		 92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  76 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  44.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  47.44 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  44.3 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  47.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  44.3 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.45 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  56.25 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  41.46 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  56.25 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  48.44 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  48.57 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  44.44 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  42.22 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  51.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  47.83 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  51.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  45.21 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  43.06 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.9 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  46.88 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  43.21 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  49.3 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  53.12 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50.77 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  46.15 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.78 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  42.47 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  50.79 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  48.48 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.83 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  47.54 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  45.71 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  50.79 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  46.88 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  45.33 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  48.44 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  51.56 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  42.67 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  48.44 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  48.39 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  49.3 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  46.88 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.89 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  51.56 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  48.44 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  43.04 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  41.77 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  48.44 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  43.66 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  46.88 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>