More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1785 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 80 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  70.13 
 
 		 77 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  54.55 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  51.43 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  50.72 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  44.16 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  46.15 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.85 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  41.1 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  51.56 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  44.93 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.61 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  48 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  44.44 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  49.21 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.53 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  55 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  38.67 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  46.27 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  38.36 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  49.23 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  45.45 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.21 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  43.48 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  44.78 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  44.78 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  42.65 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  44.16 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.15 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  46.97 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  39.73 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  40.28 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  46.97 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  39.44 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  44.12 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  44.26 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  50.82 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  39.19 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  44.12 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  39.47 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  41.94 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  43.66 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.46 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  43.06 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  45.59 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  46.03 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.71 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9692  predicted protein  46.67 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0434482  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  38.24 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  41.43 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  40.85 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  45.71 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  43.48 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  39.74 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  46.97 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  40.58 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  43.48 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  40.85 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  43.28 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  41.54 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  38.89 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>