More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2236 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  63.64 
 
 
74 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  64.62 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  58.21 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  60 
 
 
72 aa  90.9  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.24 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
69 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  56.52 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
75 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  53.73 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  58.21 
 
 
70 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.58 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  55.07 
 
 
71 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.58 
 
 
81 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  57.63 
 
 
70 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 
77 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.72 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.72 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
69 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  53.73 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  57.58 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.06 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  59.38 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  53.85 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  66.04 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  53.73 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  49.25 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  52.31 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  56.25 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
70 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  51.52 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  46.27 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  54.55 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.24 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50.75 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  54.55 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.55 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  51.52 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  54.55 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  54.55 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  47.62 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  49.25 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.69 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  55.22 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  52.24 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>