More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2575 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  53.62 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
85 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  87  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.72 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.94 
 
 
74 aa  84.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
70 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
75 aa  83.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.72 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.71 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  53.73 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  51.47 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  49.28 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  52.86 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  52.86 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1264  hypothetical protein  65.38 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000384202  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  52.86 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  65.31 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.62 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  54.41 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  47.83 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  46.48 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  49.23 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  56.72 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  50 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  44.29 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  65.31 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  46.38 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.25 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  55.71 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  56.72 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  55.1 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  60.87 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  62 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  46.48 
 
 
107 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50.7 
 
 
84 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  52.11 
 
 
79 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  61.22 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  48.57 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  47.14 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>