More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3144 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  141  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
70 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  66.67 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.97 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
68 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  55.07 
 
 
70 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3562  hypothetical protein  63.16 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.52 
 
 
74 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  57.14 
 
 
71 aa  86.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  53.62 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  48.53 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  51.47 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  56.72 
 
 
71 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  52.94 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  54.55 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  51.47 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  48.53 
 
 
75 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  53.97 
 
 
64 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  48.53 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  48.53 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  53.62 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.28 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  54.41 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  58.33 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  54.41 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  53.03 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  53.03 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  53.03 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  53.03 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.12 
 
 
91 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  48.53 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  51.47 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  49.28 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  50.72 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  45.59 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  55.88 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  53.03 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  54.41 
 
 
68 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  46.58 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  50.68 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1264  hypothetical protein  45.71 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000384202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  60.34 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.72 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  44.12 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  47.76 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  45.59 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  46.38 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2761  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
75 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000958136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  51.47 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  52.24 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>