More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3562 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3562  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  75.36 
 
 
69 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  58.82 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  58.82 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  58.82 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  58.82 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  57.35 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
70 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  58.82 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
68 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  64.29 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3144  hypothetical protein  60.61 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000206652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  58.82 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  60.61 
 
 
70 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  56.06 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  57.35 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  57.35 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
80 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56.06 
 
 
76 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
71 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  57.35 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.06 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  56.06 
 
 
85 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  87.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  57.35 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  61.4 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.25 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.25 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.41 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  55.38 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  57.35 
 
 
71 aa  84.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  62.3 
 
 
64 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.03 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  52.31 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
85 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  47.06 
 
 
107 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  54.55 
 
 
86 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  55.38 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  54.41 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.88 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  51.47 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  53.03 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  57.81 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.76 
 
 
74 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  48.53 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  51.47 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  51.52 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  48.53 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  48.53 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  51.47 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  55.74 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  51.47 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  52.31 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  59.65 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  59.65 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  51.52 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  59.65 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  55.74 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  55.74 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  52.31 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  51.47 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  51.56 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  47.06 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  55.22 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  51.43 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  52.31 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  52.31 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>