More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0809 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
98 aa  201  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 
70 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
69 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  56.34 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  48.24 
 
 
87 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9606  predicted protein  53.03 
 
 
80 aa  84  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  56.34 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  60.61 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  53.12 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  52.24 
 
 
71 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  56.06 
 
 
70 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  52.56 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  53.03 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  51.52 
 
 
75 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  55.38 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  62.5 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  58.73 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  53.73 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  53.52 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  56.06 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9692  predicted protein  50.79 
 
 
63 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0434482  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  51.35 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  52.94 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  53.03 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  42.31 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  49.33 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  54.55 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  53.03 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3122  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566659  hitchhiker  0.0000000540295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  49.41 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  53.85 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
74 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  55.88 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
71 aa  77  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  58.46 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  49.25 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  44.05 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  46.58 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.03 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  52.38 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.48 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  50.62 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  51.9 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  53.03 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  56.92 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56.06 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  45.59 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  49.25 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  56.25 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1255  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000204155  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  53.03 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  57.89 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  46.38 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  48.48 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  48.48 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  53.12 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  58.62 
 
 
73 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  49.21 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.81 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  46.84 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
71 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  54.24 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  55.07 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  55 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>