More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5013 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  197  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  68 
 
 
96 aa  133  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  64 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  75.61 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  64 
 
 
98 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  67.05 
 
 
117 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  58.42 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  63.22 
 
 
105 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  71.83 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  64.79 
 
 
95 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  65.28 
 
 
120 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  56.94 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.52 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  50.7 
 
 
88 aa  87.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  39.8 
 
 
214 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  49.3 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  56.06 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  55.07 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  56.52 
 
 
98 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  54.55 
 
 
91 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  59.7 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  48.15 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  49.35 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  52.86 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  49.25 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  52.86 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  58.21 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  51.43 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  49.35 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  49.35 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  44.12 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  44.12 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.35 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  45.83 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  45.83 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  45 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  43.84 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  49.3 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.11 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  57.97 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  53.03 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  45.95 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  44.29 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  43.62 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  56.06 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  52.94 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  49.33 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  45.71 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.71 
 
 
77 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
73 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.7 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  50.72 
 
 
82 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  42.03 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
74 aa  77  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  52.17 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  45.95 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>