More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1842 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  191  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  56.32 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  64.94 
 
 
82 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  60 
 
 
83 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  53.42 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  57.97 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  85.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  44.71 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
75 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
70 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  47.5 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.65 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  54.79 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  51.43 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.43 
 
 
206 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  48.48 
 
 
70 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  48.57 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  49.28 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  48.65 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  46.97 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  55.07 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.72 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  44.29 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  44.59 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  48.65 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  43.84 
 
 
79 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  76.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  49.28 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.44 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  53.73 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  48.57 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  50.77 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  43.04 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  48.1 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  45.71 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  45.88 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  42.03 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  47.83 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  47.76 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  39.08 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  39.08 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  39.08 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  47.83 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  56.9 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  43.66 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.74 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>