More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4526 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  68.97 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  53.16 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  54.41 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  46.84 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  54.41 
 
 
145 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  54.41 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  49.33 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  54.17 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  51.39 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  52.94 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.46 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.87 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.47 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  50.77 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  47.22 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  52.46 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  41.67 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  52.46 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  43.66 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  44.59 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  42.17 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  44.12 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  44.12 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  48.53 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  49.18 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  47.06 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  43.24 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  44.62 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  54.1 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  47.62 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  44.62 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 
69 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  50.85 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  41.67 
 
 
111 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  50.82 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  42.67 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  41.25 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  48.44 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  51.61 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  44 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  45.59 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.25 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  43.48 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  49.3 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  46.75 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  46.27 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  47.14 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  49.18 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  44.29 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  41.89 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.95 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.97 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  41.1 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  49.28 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  48.39 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  44.12 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  44.44 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>