More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2036 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  57.35 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  51.35 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  57.35 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  54.69 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  56.45 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  60.94 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.79 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  59.26 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  47.14 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  52.94 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  57.41 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.83 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  52.24 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  65.31 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  51.47 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  51.47 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  67.39 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  47.13 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  67.39 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  51.47 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1255  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000204155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  51.28 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  47.22 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  51.9 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  40.54 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  64.58 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.73 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.7 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  47.44 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  48.53 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  52.78 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  46.05 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  48.1 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  45.68 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  62.5 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  61.22 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  50.75 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  47.56 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  43.9 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  53.23 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  57.14 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  48.53 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  58.33 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  54.84 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.95 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  46.97 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  43.24 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  46.97 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  52.94 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  62.5 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  43.24 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  45.57 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  43.42 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  46.38 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  50.77 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  51.43 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  48.68 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  53.23 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  42.5 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>