More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1652 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  251  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  52.53 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  53.19 
 
 
111 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  50.52 
 
 
123 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  55.56 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  49.07 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  50.53 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  52.13 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  49.49 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  55 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  48.94 
 
 
105 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  49.5 
 
 
136 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  53.68 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  53.68 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  53.19 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  48.89 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  53.95 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  47.67 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  55.88 
 
 
97 aa  84.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  56.72 
 
 
80 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  61.9 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  48.91 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  48.53 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  62.3 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  48.68 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  53.33 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  53.33 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  46.91 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  62.71 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.9 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  48.68 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  52.31 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  55.17 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  47.14 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  54.24 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  50.77 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  54.24 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  45.24 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  51.47 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  55.93 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  55.74 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  48.65 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  57.38 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  50.79 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.94 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  55.38 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  47.06 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  47.76 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  54.1 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50.79 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  44.3 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  47.54 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  46.84 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  50.79 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  60.38 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.79 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  49.21 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.32 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  43.06 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  38.04 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  43.06 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  47.22 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  50.85 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.23 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  56.6 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  50.79 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  44.78 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  44.59 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  50.82 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  51.72 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.03 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  54.24 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1255  protein of unknown function DUF37  63.27 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000204155  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  53.45 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  47.54 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  44.78 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  49.18 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  48.28 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50.85 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  45.59 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2474  hypothetical protein  45.21 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00217526  hitchhiker  0.000573367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  50.82 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>