More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0005 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  85.51 
 
 
69 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  70 
 
 
70 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  60.87 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  89.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  59.09 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  57.97 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
87 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  57.97 
 
 
84 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.29 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  57.97 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  57.97 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  50.72 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.71 
 
 
74 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  54.55 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  46.38 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  52.86 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  51.43 
 
 
214 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.24 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.03 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  56.06 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  54.41 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.86 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.43 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  52.17 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  56.06 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
69 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
91 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  46.38 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  48.53 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  53.03 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  49.23 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  60.38 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  48.48 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  47.83 
 
 
68 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  46.48 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  51.52 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50.75 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  50.75 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.06 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  51.43 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  44.78 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.85 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  46.38 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  48.57 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  60.38 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.93 
 
 
74 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  45.45 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  48.48 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>