More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2389 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2474  hypothetical protein  49.57 
 
 
124 aa  123  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00217526  hitchhiker  0.000573367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2145  hypothetical protein  49.17 
 
 
124 aa  120  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165245  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 
76 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  55.22 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  54.05 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.43 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  45.21 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  45.59 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  47.95 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  45.59 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  54.41 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  45.59 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  48.53 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  48.57 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  48.53 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  56.92 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  45.59 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  47.06 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.94 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.94 
 
 
77 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  54.41 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  46.48 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
80 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  48.1 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  56.06 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  52.05 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  52.24 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  46.38 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.29 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  48.53 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  50.75 
 
 
74 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.71 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  50.65 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  47.95 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50.75 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  48.53 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  50.65 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  50.65 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  54.1 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  54.84 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  50.65 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
75 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  47.83 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  46.58 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  48.57 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  48.65 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  45.45 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  56.45 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  47.14 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  43.84 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>