More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4641 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  82.86 
 
 		 106 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  83.5 
 
 		 105 aa  175  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  81.9 
 
 		 115 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  83.33 
 
 		 111 aa  174  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  85.37 
 
 		 101 aa  146  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  62.37 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  56.57 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  56.31 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  65.85 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  65.38 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  56.38 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  60.87 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  65.38 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  62.82 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  58.54 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  60.53 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  64.86 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  56.79 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  61.84 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  59.52 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  59.52 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  52.13 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  57.83 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  56.63 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  47.3 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  45.95 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  45.95 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  47.14 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  45.31 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  45.07 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  42.25 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.84 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  43.66 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  49.18 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  47.54 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  47.54 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  46.48 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  47.54 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  52.54 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  44.26 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  45.9 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  47.54 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  44.26 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  45.9 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  45.9 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  44.26 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  47.54 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  44.62 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  49.21 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  50.79 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  47.22 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  42.03 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  50.82 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  45.07 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  43.48 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  49.15 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  39.39 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  40.4 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  47.22 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.15 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  49.18 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  37.68 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  46.15 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.62 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  45.07 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  39.51 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  50 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  49.18 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  39.13 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2474  hypothetical protein  37.21 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00217526  hitchhiker  0.000573367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  46.77 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  50.79 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  36.9 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  46.27 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2145  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165245  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  41.94 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  46.88 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  36.9 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  42.03 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>