More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2209 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  63.16 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  63.91 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  66.99 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  60.19 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  55.66 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  54.31 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  59.41 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  59.41 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  54.74 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  55.56 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  46 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  54.88 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  55.29 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  53.33 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  56.79 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  56.63 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  54.32 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  55.42 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  47.47 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  54.67 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  50.67 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  63.93 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  48.35 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.17 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  56.25 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  51.47 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  51.35 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  55.22 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  47.3 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  55.56 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.3 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  55.38 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  53.97 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  44.59 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  53.97 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  49.3 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  48.53 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  48.53 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  49.23 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  48.44 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  45.57 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.12 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  45.57 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  50.75 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  43.06 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  51.52 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  50.72 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.75 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  44.59 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  46.91 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  52.38 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  48.61 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  45.07 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  47.89 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  44.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  46.48 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  52.38 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2145  hypothetical protein  41.46 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165245  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  52.94 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  44.93 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  42.25 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  44.12 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.76 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  44.93 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  48.19 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  44.29 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  47.89 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  44.12 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>