100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1534 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  41 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  39.56 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  38.49 
 
 		 349 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  41.67 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  37.21 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  36.36 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  36.25 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  32.14 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  35.26 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  28.65 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  32.39 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  31.25 
 
 		 187 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  36.67 
 
 		 201 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  32.81 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  32.98 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  32.81 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  32.26 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  33.16 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  31.25 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  30.11 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  31.09 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  31.09 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  31.09 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  29.9 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  31.09 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  28.35 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  33.16 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  27.57 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  28.43 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  28.02 
 
 		 179 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  31.61 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  30 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  30.77 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  29.28 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  30.65 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  30.65 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  30.39 
 
 		 175 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  31.35 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  27.62 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  28.04 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  28.86 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  28.86 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  27.75 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  29.05 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  25 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  28.5 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  32.42 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  25.81 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  30.6 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  31.49 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  28.72 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  26.37 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  32.42 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.11 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  28.88 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  28.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  29.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  29.74 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  29.53 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  23.93 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  24.07 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  25.39 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.4 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  27.09 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  20.59 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  27.57 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  32.8 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.59 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  26.5 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  23.76 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  24.83 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  29.14 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  20.9 
 
 		 365 aa  49.3  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  26.57 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  28.24 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  27.05 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  25.58 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  27.78 
 
 		 363 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  23.42 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  26.02 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  27.78 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  23.08 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  32.22 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  26.74 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  26.57 
 
 		 222 aa  45.4  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1406  cytochrome B561  30.29 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  24.47 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  30.08 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  27.94 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  29.35 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2058  cytochrome B561  29.63 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  27.56 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1708  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.41 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.33968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1649  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.41 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0173  cytochrome B561  29.63 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1799  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.41 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1634  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.41 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  32.47 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>