190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0744 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  100 
 
 		 387 aa  793    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  28.57 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  33.33 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  33.33 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  42.25 
 
 		 243 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  41.98 
 
 		 245 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  38.22 
 
 		 237 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  36.13 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  41.51 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  42.62 
 
 		 198 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  38.99 
 
 		 242 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  26.63 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  41.67 
 
 		 239 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  41.21 
 
 		 195 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  42.63 
 
 		 236 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  41.21 
 
 		 195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  41.08 
 
 		 198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  41.21 
 
 		 195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  41.21 
 
 		 195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  41.21 
 
 		 195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  39.23 
 
 		 198 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  39.78 
 
 		 212 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  39.25 
 
 		 192 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  37.57 
 
 		 198 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  43.24 
 
 		 203 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  36.74 
 
 		 201 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  35.11 
 
 		 231 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  36.72 
 
 		 187 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  33.18 
 
 		 214 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  34.15 
 
 		 222 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  36.87 
 
 		 182 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  34.3 
 
 		 218 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  38.64 
 
 		 177 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  39.57 
 
 		 210 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  36.81 
 
 		 219 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  38.27 
 
 		 204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  34.81 
 
 		 226 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  34.78 
 
 		 195 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  35.16 
 
 		 228 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  42.54 
 
 		 160 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  44.17 
 
 		 163 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  32.42 
 
 		 228 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  35.91 
 
 		 181 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  32.11 
 
 		 202 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  35.16 
 
 		 193 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  35.77 
 
 		 160 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  33.7 
 
 		 226 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  30.94 
 
 		 229 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  35.64 
 
 		 241 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  38.69 
 
 		 168 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  39.23 
 
 		 162 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  37.36 
 
 		 221 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1534  cytochrome B561  32.14 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  36.56 
 
 		 200 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  31.43 
 
 		 265 aa  99.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  36.18 
 
 		 212 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  36.7 
 
 		 191 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  38.67 
 
 		 182 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  38.98 
 
 		 190 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  31.63 
 
 		 236 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  38.98 
 
 		 190 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  33.89 
 
 		 175 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  32.24 
 
 		 202 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  31.67 
 
 		 184 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  35.57 
 
 		 186 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  35.77 
 
 		 153 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  34.85 
 
 		 188 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  33.33 
 
 		 226 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  30.23 
 
 		 227 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  32.4 
 
 		 191 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  37.5 
 
 		 168 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  30.37 
 
 		 255 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  31.73 
 
 		 229 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  32.45 
 
 		 199 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  32.45 
 
 		 199 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  38.52 
 
 		 161 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  32.02 
 
 		 179 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  35.92 
 
 		 183 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  35.92 
 
 		 183 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  31.85 
 
 		 168 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  33.87 
 
 		 219 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  37.7 
 
 		 170 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  32.97 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  37.7 
 
 		 162 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  35.66 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  35.66 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  30.73 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  35.97 
 
 		 148 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  32.09 
 
 		 219 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  33.09 
 
 		 173 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  29.91 
 
 		 221 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  34.83 
 
 		 175 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  30.73 
 
 		 230 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  32.24 
 
 		 249 aa  89.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  28.93 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  33.51 
 
 		 227 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  35.25 
 
 		 187 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  34.31 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  35.25 
 
 		 187 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  27.6 
 
 		 261 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>