160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0326 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  57.87 
 
 
226 aa  232  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  53.3 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  50.72 
 
 
232 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  46.2 
 
 
226 aa  177  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  44.81 
 
 
265 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  42.2 
 
 
226 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  42.66 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  52.15 
 
 
266 aa  158  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  39.17 
 
 
228 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  41.49 
 
 
221 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  37.02 
 
 
228 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  36.84 
 
 
231 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  46.24 
 
 
225 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  43.12 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  45.36 
 
 
222 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  39.52 
 
 
221 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  48.65 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  42.86 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  40.93 
 
 
222 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  44.26 
 
 
222 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  38.97 
 
 
230 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  36.7 
 
 
229 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  41.21 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  38.97 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  38.97 
 
 
230 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  38.97 
 
 
230 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  36.16 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  42.31 
 
 
219 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  41.71 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  41.71 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  37.38 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  41.75 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  41.63 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  41.45 
 
 
249 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  34.42 
 
 
229 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  34.42 
 
 
229 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  38.97 
 
 
241 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  34.42 
 
 
229 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  37.21 
 
 
230 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  40.21 
 
 
193 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  36.14 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  35.89 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  42.45 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  42.55 
 
 
200 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  33.8 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  38.74 
 
 
222 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  37.3 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  39.04 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  35.96 
 
 
229 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  35.45 
 
 
212 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  31.44 
 
 
202 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  35.71 
 
 
237 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  32.04 
 
 
239 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  35.16 
 
 
243 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  37.43 
 
 
363 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  37.43 
 
 
363 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  30.41 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  33.51 
 
 
387 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  40.31 
 
 
190 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  33.48 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  32.97 
 
 
192 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  37.02 
 
 
349 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  40 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  32.49 
 
 
198 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  32.83 
 
 
198 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  35.75 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  32.83 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  32.46 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  36.96 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  33.68 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  33.68 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  33.68 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  33.68 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  34.21 
 
 
195 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  32.04 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  36.56 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  33.33 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  33.88 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  40.71 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  33.52 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  36.51 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  34.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  30.33 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  27.49 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  31.55 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  32.57 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  32.83 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  30.09 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  32.42 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  32.79 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  30.6 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  33.16 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  27.83 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  33.16 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  30.37 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  26.72 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  33.51 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  33.16 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  32.6 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>