133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0461 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  50 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  50.27 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  44.86 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  50.84 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  46.08 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  48.63 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  50.29 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  48.63 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  48.63 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  41.59 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  41.15 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  45.71 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  45.71 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  45.71 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  47.46 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  43.41 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  35.1 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  41.71 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  34.63 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  40.78 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  41.9 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  39.11 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  38.67 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  38.19 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  39.44 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  36.06 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  35.11 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  43.2 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  35.26 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  36.19 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  37.08 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  37.3 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  35.75 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  33.51 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.46 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  36.41 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  34.11 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  38.95 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  31.67 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  31.67 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  32.58 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  34.81 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  33.15 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  34.97 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  32.7 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  30.11 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  34.2 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  30.9 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  30.69 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  32.63 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  35.14 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  33.52 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  29.94 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  31.84 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  38.17 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  38.17 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  38.17 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06855  cytochrome b  37.93 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  30.16 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  38.17 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  33.51 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  36.36 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  36.64 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  31.78 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  32.97 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  33.69 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  39.5 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  32.79 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  28.8 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  29.59 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  28.22 
 
 		 387 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  29.1 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  29.1 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  34.82 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  27.01 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  32.14 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  31.11 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  32.14 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  25 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  31.78 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  28.02 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  28.02 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  28.02 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  27.59 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  30.56 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.86 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  29.38 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  32.98 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  28.57 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  29.38 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  28.41 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  27.51 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  27.37 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  27.9 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  27.9 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  30.09 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  30.73 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  29.84 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  29.38 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>