129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1299 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  98.7 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  99.13 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  99.13 
 
 
230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  79.13 
 
 
229 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  79.13 
 
 
229 aa  360  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  78.26 
 
 
229 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  74.78 
 
 
230 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  73.04 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  61.3 
 
 
230 aa  297  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  61.5 
 
 
231 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  58.85 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  58.93 
 
 
222 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  56.96 
 
 
221 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  56.76 
 
 
222 aa  252  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  47.37 
 
 
231 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  44.7 
 
 
213 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  40.18 
 
 
219 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  44.75 
 
 
236 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  38.16 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  34.39 
 
 
228 aa  148  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  41.36 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  36.99 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  41.08 
 
 
226 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  36.36 
 
 
226 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  45.6 
 
 
249 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  35.27 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  39.19 
 
 
228 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  40.32 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  38.97 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  37.32 
 
 
221 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  36.07 
 
 
241 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  39.81 
 
 
227 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  35.98 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  36.41 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  40.33 
 
 
221 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  36.22 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  36.22 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  38.86 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  40.22 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  40.31 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  41.36 
 
 
195 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  41.36 
 
 
195 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  41.36 
 
 
195 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  41.36 
 
 
195 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  36.65 
 
 
198 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  33.51 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  39.13 
 
 
198 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  36.79 
 
 
192 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  39.06 
 
 
198 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  39.06 
 
 
198 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  39.11 
 
 
219 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  36.84 
 
 
252 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  31.79 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  32.62 
 
 
212 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  31.28 
 
 
222 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  31.22 
 
 
239 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  37.76 
 
 
225 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  35.14 
 
 
198 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  34.07 
 
 
195 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  38.59 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  33.33 
 
 
193 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  34.25 
 
 
182 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  33.85 
 
 
203 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  34.83 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  30.73 
 
 
387 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  32.04 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  33.33 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  30.04 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  30.05 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  34.41 
 
 
190 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  34.78 
 
 
190 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  32.45 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  30.23 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  33.7 
 
 
349 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  29.19 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  32.2 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  32.6 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  36.75 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  32.8 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  27.8 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  31.69 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  28.8 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  27.17 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06855  cytochrome b  34.64 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  31.87 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  33.51 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  32.8 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  33.51 
 
 
363 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  35.75 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  33.54 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.86 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  31.15 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  35.36 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  32.02 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  27.96 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  34.78 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  32 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  30.94 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  30.93 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>